有人在跑「Folding@HOME™」蛋白質摺疊嗎?

浩雲

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PC及PS3的「Folding@HOME™」都是一樣的,再您的PC或PS3上安裝了一個程式,這個程式可以利用您PC或PS3多餘的運算能力,來幫助史丹佛大學解算研究人類蛋白質的摺疊現象



「Folding@HOME™」是為了研究人類蛋白質的摺疊現象,並理解關連疾病而發起的試驗計畫。要探究因蛋白質的異常摺疊而引發的巴金森症、阿滋海默症、癌症等各種疾病的肇因,耗用龐大運算能力的分析是不可或缺的一部分。搭載擁有卓越演算能力之Cell Broadband Engine™ (Cell/B.E.)的PS3™對分析的貢獻,將幫助原因的進一步究明。



由於蛋白質的摺疊過程非常複雜,因此透過電腦模擬的研究堪稱是不可或缺。若由一台電腦進行這套模擬過程,最大可能需要耗費將近30年的歲月,故美國史丹佛大學計畫向每台參加「Folding@HOME™」的終端機傳送切割龐大運算內容後產生的無數Task(工作單位),經由多數終端機的平行處理來縮短分析需耗費的時間。各終端機的計算處理結果會於運算結束的同時,透過網際網路回傳給美國史丹佛大學。Cell/B.E.擁有相當於標準個人電腦10倍左右的運算能力,因此PS3™若能參加這項計畫,可望能令研究的開發速度飛躍提昇。



Sony Computer Entertainment Inc.(以下簡稱SCEI)已開始提供能讓PLAYSTATION3(以下簡稱PS3)支援美國史丹佛大學推動的分散式運算(*1)計畫「Folding@HOME™」的應用程式。


如各位所知,Folding@home是一個「研究蛋白質折疊,誤折,聚合及由此引起的相關疾病的分散式計算工程,」據稱現在已經有超過一百萬顆CPU參與了Folding@home計畫-但是看起來它的老爹Vijay Pande並不滿足於此,他又開發了一種新軟體以利用顯卡GPU的raw processing power預處理能力。

Pande說甚至最新的雙核CPU在浮點運算上都不如ATi的X1900/X1950顯示卡,他估算一個Core 2 Duo晶片可以為Folding@home的運算帶來250億次/秒的浮點操作能力,但一個已投入量產的高端ATi顯卡卻可以釋放出3750億次/秒,是該專案迄今為止速度的20至40倍。

Pande 小組已經為這個以GPU為中心的軟體優化了演算法,期望它能將GPU們已然令人印象十分深刻的表現再提高10到15倍。目前這個軟體的beta版本還只能應用於X1900,不過他們已經計畫在不遠的將來將X1800系列也收入囊中。Pande甚至提及ps3版本也在籌畫研究當中。

以前有跑過,但是電腦跑的太慢

在友站看到成功大學的團隊,就加入了

正好顯卡是ATI 3850

用針對ATI 26xx, 3xxx系列顯卡的6.11 beta3版

跑起來不輸PS3的運算效能

有ATI 26xx, 3xxx系列顯卡的大大想試一下的話

可以到: http://www.mobile01.com/topicdetail.php?f=174&t=590205&p=1
 
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狂少

Bulletproof Themer
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我用PS3跑的
 

fjh3uioc

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參加多項
找外星人的
重力波的
蛋白質的

...9項吧
 

kakapopo

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玩過30秒就宜除了
不好玩><
 

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剛剛看完相關介紹,這真的是好大的研究規模~
 

sean_robot

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兩台雙核心在跑...不過按照個人慣例不使用BETA版,所以跟單核跑差不多(只吃一核

不過我倒是不知道26XX可以跑了...

...可是我是780G說(喂

說真的,以現在使用內顯電腦的數量來看,用內顯來算說不定也能有驚人的處理量,再不濟也有P4到單核CORE等級的處理能力吧?
 
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